他恨不得杀了灵秀，可现在灵秀绝不能死，更不能死在他的手里，一死，就再也说不清楚了。（这是真实历史里北魏曾发生过的法秀起义）
元瑜盛怒，气得手脚发颤，就在他眼皮子底下，就在兰京平城，竟然发生了一寺方丈聚众六七百人就敢起事造反的奇闻。
这不是打他的脸，而是把列祖列宗的脸都给打了！
先是贺旸被大乘教刺杀，接着就是灵秀造反，元瑜对佛宗的厌恶逐渐升至了极点，又有崔伯余在旁进言，终于对佛宗进行了严苛的限制和惩罚。
首先，勒令三十岁以下的佛门弟子全部还俗，由此控制沙门无止境的扩充僧人数量；其次，王公以下至庶民，不许私养沙门，凡家中豢养沙门的，限期送至官府，过期胆敢藏匿，一经抓获，沙门身死，主人门诛。由此斩断了沙门勾结贵戚、扎根民众的途径；还有，朝廷成立沙门统，绾摄僧徒，把所有为了逃避赋税劳役而依附于沙门的农户编成僧祇户，同样缴纳赋税，服调劳役，如果遇到战事，还可征召为兵户。由此掐住了沙门的钱财来源。
诸如此类，佛宗受到了前所未有的重击，灵智靠着太子元泷的保护，暂时得以无恙，主要还是灵秀造反的过程近似儿戏和无脑，元瑜也不信和灵智有关，但他被逼得只能在永宁寺修行，轻易不得外出，更别说参赞朝政。
然而，这并不是结局。
这天夜里，元沐兰、鸾鸟、崔伯余和康静同时进宫，元瑜吓了一跳，还以为有什么大事，赶紧披衣接见。
鸾鸟道：“陛下，经我仔细查证，刺杀贺旸的人，应该就在平城。”
“嗯？”元瑜道：“查到什么线索吗？”
鸾鸟侧头望向元沐兰，元沐兰微微弯腰，道：“我曾在永宁寺和大和尚交手，这几日查验渤海公的死状，似乎与大和尚的菩提功颇有些吻合之处。”
“什么？”
元瑜惊怒交加，道：“灵智敢这样欺君？天师，你怎么说？”
康静低头道：“同公主一样，我和大和尚也曾切磋过，对他的菩提功略有了解，渤海公之死，确实和菩提功脱不了干系。但是，请陛下暂息雷霆之怒，菩提功并非大和尚一人的绝学，他的弟子大多修习的也是菩提功，很可能流传于外，被大乘教的余孽学了去，此案，未必和大和尚有关。”
元瑜的脸上阴晴不定，过了半响，道：“鸾鸟，你指证大和尚，可有实据？”
鸾鸟道：“刺杀渤海公的是二品小宗师，平城之内，二品不过寥寥数人，经查，出事当晚，康天师和崔仆射在道观饮酒赏月，还有从者十余人可以作证。秀容公主也在府内设宴，邀请了王宫大臣们的妻女共同赏月。至于素阙机，虽然没有公开露面，能为她作证的也只有我，但众所周知，她的身形和刺客相差甚远，不可能是同一人。唯有大和尚，说是那夜在禅房静修，却只有弟子的证言，并无外人可以旁证。而公主和天师都是二品，皆认定渤海公死于菩提功，陛下，无论如何，大和尚的嫌疑最大，我建议立即抓捕，交由南狱审讯，不怕他不招……”
“胡闹！”元瑜斥道：“灵智是当朝国师，佛宗僧主，岂是你说抓就能抓的？”
鸾鸟噘噘嘴，根本不把元瑜的斥责放在心上，道：“陛下，沙门包藏祸心，先是大乘教，后有正始寺，灵智身为僧主，怎可能置身事外？尽早除此凶獠，免得遗祸无穷。”
元瑜被她顶撞的心烦，问崔伯余道：“桃月，你的看法呢？”
“臣以为，灵智必定是刺杀渤海公的刺客！”
崔伯余从不无的放矢，元瑜对他很是信任，皱眉道：“理由呢？大和尚总不会无缘无故去杀贺旸，对他有什么好处？”
“灵智要反！”
崔伯余只管给灵智扣上大帽子，现在图穷匕见，不是你死就是我亡，容不得半点犹豫和慈悲，道：“大乘教极可能是灵智的棋子，用来扰乱地方，诱主上和中军离开平城，然后他就可以趁机举事，联合高腾等人占据平城，再和大乘教里应外合，倾覆我朝江山社稷。只不过这个计划还没来得及发动，就被公主误打误撞，提前抓住了高腾，陛下旋即回京，让灵智不敢妄动。后来大乘教被公主平定，地方渐安，灵智心知不能再等，刺杀贺旸，有两方面的算计，一是打着为大乘教报仇的旗号，收拢大乘教余孽为己用；二是利用贺旸的死，故意激怒陛下对佛宗进行全面打压，他可以号召佛宗弟子同起反抗……”
元瑜腾的站起，帝王的威严弥散开来，几乎让人喘不过气，道：“沐兰，由你率兵包围永宁寺，天师和鸾鸟从旁协助，灵智若敢反抗，杀无赦！”