当日晚，南京日本“中国派遣军”总司令部冈村宁次向全体驻华日军各部队下达命令：“即时停止战斗行动”；但同时他又向日军各部队指出：“事已至此，应向每一士兵贯彻，均应忍所难忍，迅速响应圣训。但战斗行动以外之任务应继续执行。停战交涉未达成协议前，敌若来攻，在不得已情况下，为了自卫，可采取战斗行动”。
日本“中国派遣军”总司令部派遣副总参谋长今井武夫少将，会同日驻华海军代表小川少将，一齐去见伪国民政府陈公博，报告“日军决以最大诚意履行投降条件”。日本驻南京伪政府的大使谷正之也拜见陈公博，说明“日本投降已没有问题”。
失去了日本靠山的南京伪政府迅速土崩瓦解。第二天上午，伪行政院副院长兼伪上海市市长周佛海从上海赶回南京。他此时已秘密接受了重庆军委会委任他为“上海行动总指挥”的命令。
当日下午，由陈公博主持召开伪政治委员会的会议，决议解散伪国民政府，并发表《国民政府解散宣言》，立即送电台广播与送各报社刊登；会上又决定，将原伪“政治委员会”改为“南京临时政务委员会”，陈公博为委员长，周佛海副之，原伪“军事委员会”改为“治安委员会”，亦由陈公博为委员长，周佛海副之。
以上二机构将暂时负责维持南京等地的社会治安，等待重庆政府接管，当晚这些决定由南京伪“广播无线电台”播出。
直到8月30日重庆国民政府空运新六军到达南京前，这约半个月的时间中，驻南京的日军各部队虽回到营房中，但仍保持武装；驻南京的汪伪军各部各自为政，互相僵持对立；而在南京四郊农村活动的新四军也对南京展开宣传攻势，南京呈现混乱与紧张的***面。
8月27日下午2时40分，以重庆国民政府陆军总司令部副参谋长冷欣中将为首的“国民政府陆军总司令部前进指挥所”一行一百五十九人，另有即将进驻南京的新六军前进指挥所官兵五十二人，携电台一部，指挥车两辆，分乘七架飞机，从湖南芷江飞抵南京大校场机场。冷欣一行被安排住在南京中山北路华侨招待所，这地方的对面就是日本“中国派遣军”总司令部所在地。
当晚冷欣在这里正式设立“前进指挥所”，下分设一、二、三、四、特科、政治、总务、警卫共八个组。冷欣本人则被日方安排在南京城北萨家湾一号原孙科公馆、后成为汪伪政府的迎宾馆中住宿。第二天，冈村宁次在今井武夫陪同下，亲自前往萨家湾一号，拜会冷欣，冷欣向冈村宁次转交何应钦新发来的致日军的第8至第13号备忘录。
8月30日至9月5日，重庆国民政府从湖南芷江空运精锐的、美式装备的新六军，陆续抵达南京及其附近地区。这是自从1937年12月13日日军占领南京后近8年，中国军队第一次回到这块备受日军摧残与凌辱的土地，受到南京市民的热烈欢迎。新六军担任南京及周边地区的警备。只是从这时起，南京城才真正结束了日军刺刀下的殖民统治，获得光复。
南京河山光复，人民巨大喜悦！一位身经其事的南京市民，在垂暮之年，写了回忆文章，刊登在2003年4月3日的南京《扬子晚报》上，说：“
1945年日军无条件投降，一宣布，他们站岗用的枪全换成了训练时的木头枪。真枪真刀都被集中缴械了。那真是南京人扬眉吐气的日子，人们都兴高采烈地冲上街头狂欢，新街口马路上炸过的鞭炮纸屑足有半尺厚，家家商店的玻璃橱窗、玻璃门上都大大地写着V字。
解除了灯光管制后，南京一夜之间亮起来了，百姓家的灯去掉了罩了多年的灯罩，街上的霓虹灯去掉了蒙了多年的黑布。不可一世的日本人一扫往日的气焰，军人脱了军装、缴了武器；商人匆忙收拾货物，打点行装。
那天我也在看热闹的人群中。我看见那些日本军人个个低着头，手捧同伴的骨灰盒，列队向下关集中营走去。一路上，中国民众向他们吐口水，投石块，下关的百姓甚至还气愤地拳打脚踢这些曾经欺压中国人的仇敌，还有人命令日本鬼子向中国人下跪，鬼子们只得照办。
那些日本商人也在撤退中，他们雇了黄包车托运货物行李，老百姓看见了，齐声高喊：“滚下来，自己拉！”这些日本商人不管是男还是女，都只好下车自己拉车。黄包车夫们咧开嘴笑着跟在车后。那个场面真叫痛快呀！“
1945年9月8日中午12时1刻，中国国民政府陆军总司令、盟军中国战区受降主官何应钦与陆军参谋长萧毅肃，从湖南芷江飞抵南京，南京市各机关代表到机场迎接。日方的“中国派遣军”总司令官冈村宁次大将、总参谋长小林浅三郎中将、副参谋长今井武夫少将等将领，另成一列，肃立恭迎。
何应钦等人于1945年9月9日上午9时，在南京黄埔路陆军总司令部大礼堂，举行中国战区日军投降签字仪式，宣告日本侵华战争的彻底失败！
但如今，局势已经完全不同，老鬼子岗村宁次早就魂飞魄散了，中国军队反抗侵略者的抗争在如日冲天，飞虎特战队也早已经摸清楚了长江沿岸和浙东的地理形势，别说是台风高发的时间了，便是浙东和长江入海口的潮汐情况，都已经有了三年多的记录。
参谋总部打算分出一支偏师占领台州，助力白崇禧部领兵北上宁波，同时还需要派出另外一支偏师袭扰松江，靖江等地，牵制住南京和杭州的日军，以确日军不敢在宁波集中更多兵力，这便是国军的“瞒天过海，声东击西”之策，行军的便利和隐蔽是计划得以实行的基础。
林一凡站在舵楼的栏杆处，扫视面前即将出发的庞大舰队，意气风发，踌躇满志，他对着身旁的刘长风道：“反攻南京，光复首都，乃是我们的唯一取胜之道。而浙东便是此略的重中之重，这话我已经无数次说过，但此役必须一次功成，否则咱们很难再有如此合适的机会。”
“这次东进反攻虽然有参谋总部制定的详细计划和各种预备方案，但战场局势变幻莫测，终究还是需要战场指挥官及时做出决断的，我随军北上，便是要看你和张禄要如何打！”
林一凡刚刚说完，周围的几艘巨舰忽然响起了水手们震天的喊声，周围的那些小船也随着号声响起，无数士兵汇聚在甲板上，无不面色激动。
宽大的江面上，密密麻麻的船只驶出了合肥的港口，林一凡凝视着北方和天际相交的地平面，深深吸了一口气，他们将入海前往浙江沿海的舟山群岛，乘风破浪而去。
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国军东进的同时，一支提前出发的小队新海军出现在健跳所千户城周围的海面上，其中有六艘小舰艇直接开到了城下，直接用火炮把千户城的城门打开了。当前，不仅仅是健跳所千户城，便是周边的海澳，南田等地，都已经被国军派兵控制，并建立了哨岗。
当新海军进入健跳所千户城的消息最终传到台州城的时候，刘秃头又开始了他的表演，一方面让麾下的伪军们加强城防戒备，另一方面死活不肯出兵，口口声声说那是国军的声东击西的阴谋，守城的日本军官本就战战兢兢，也就选择了相信刘秃头的话。