但最后不管是渚薰还是绫波丽，都选择了碇真嗣，只能说碇真嗣是人见人爱，花见花开。大家都愿意和碇真嗣融合。
或许是因为碇真嗣没有强烈的欲望，不会以自己的贪欲去融合，而是会为大家去融合。
Seele和碇源堂都是为了自己，在他们的天才计划里，并没有考虑过别人。可谓是计划是天才制定的，而是蠢材执行的。
碇真嗣、渚薰、绫波丽都是执行者，他们选择碇真嗣也算有点道理，毕竟执行者全是问题少年，比较之下，碇真嗣真的会为别人考虑。
所以就有分歧，不管是人类，还是使徒，只要有自由的意志，就会有不同的选择。
在各种各样的选择的推动下，碇真嗣被动地成为了人类补完计划的主导者，但他自己根本不知道应该怎么做。
根据《新世纪福音战士》的设定，融合重启不是一次两次了，而是很多次，最后一次重启，碇真嗣创造了一个没有使徒力量的普通人的世界。
这也算是弱者道之用了。强者都有自己的目标、自己的计划。但碇真嗣是弱者，他一直随波逐流，但最后渚薰和绫波丽都选择了他，因为作为使徒，他们相信碇真嗣可以创造一个让人类和使徒都幸福的世界。
不过碇真嗣肯定不会一步到位，所以融合了很多次，重启了很多次。
碇真嗣也毁灭过人类，甚至只剩下他和明日香的时候，他还想掐死明日香。因为他根本不知道应该怎么做，只觉得很麻烦。这个时候他也选择灭世。
因为只要毁灭，一切就都可以解决。
叶磷石最后的选择和最初的碇真嗣差不多，也是要毁灭一切，把人类存在的痕迹彻底消除。
但经历了一次次的重启之后，碇真嗣选择了接受现实，接受人类的分歧，接受自由的诅咒，让大家都正常地生活，而不是毁灭人类。
当然计划是天才制定的，是蠢材执行的。叶磷石最后也没有完全毁灭人类，因为接受她保护的新生命一样有自由意志。在叶磷石自我销毁的时候，新生命救出了他，带着他乘坐月人的飞船去往了新的星球。
人类从历史中学会的教训就是人类从来不会吸取教训。哪怕地球上产生了一批又一批的新生命，却总是掉进自由的诅咒之中难以自拔，不吸取人类的教训，不停重蹈覆辙。
其实这些问题，庄子就已经考虑过，写过一个寓言故事，叫做‘蜗角之国’，就是说蜗牛触角上有两个渺小的国家，打得不可开交。
但在普通人看来，没人在意这些渺小生物的战争，他们的战争毫无意义。
但不管是蜗角之国，还是宝石之国，大家还是做着无异议的斗争，因为他们有自由的意志，必须采用暴力解决自由带来的分歧。
除了暴力，也可以采用辩经、占卜、抽签、选举、比赛等等方法解决分歧，但暴力总归是最终的保留节目。
“在使徒的世界，人类挡了使徒的路。在这里，宝石人挡了月人的路。月人的目标是找金刚老师完成一场月人补完计划。”杜兰说道：“最后月人和宝石人一起补完，由叶磷石来决定未来如何。到底是带着人类的记忆去往新世界，还是毁灭人类的一切痕迹。”
叶磷石是准备毁灭一切痕迹的，包括自己。但新生命却有不同的想法，哪怕他们接受了叶磷石的保护和教育，依旧有不一样的选择，就和叛逆的孩子一样救下了叶磷石。
可见自由的诅咒还将继续，从一个星球去往另一个星球。
叶磷石就不应该保护新的生命，而是应该将生命彻底消除，才能真正消除自由的诅咒。不然新的生命就像叛逆的孩子，不会对父母言听计从，直接破坏了叶磷石的计划。