最后，尧让舜独自去山麓的森林中，经受大自然的考验。舜在暴风雷雨中，能不迷失方向，依然行路，显示出很强的生活能力，经过多方考验，尧见识到了舜不凡的才能以及高尚的品德，舜终于得到尧的认可，于是帝尧便命人准备，将共主之位传与舜。
而帝尧在位期间，没有少宣传西方教，但是效果并不是很好，早在三皇五帝之前，人阐截三教便已经开始在人族传教，而西方教仅限于西方，虽然有帝尧的宣传，但西方教相对于人族来说太过偏远，不过好在也还是有一些人信奉西方教的，这也让西方教在东方小小地兴盛了一把。
而舜的师父则是截教的金灵圣母，至于截教大弟子多宝道人则被安排在了最后一尊人皇之师，舜在即位人族共主之位后，金灵圣母自然也是相伴其旁个，为他排忧解难，并且教导他修行之法。
在截教的支持之下，帝舜便开始放手施为，先，帝舜通过观测北斗星，来考察日、月及金、木、水、火、土五星的运行是否有异常，接着举行临时仪式祭告诸圣，用把祭品放在火上烧的仪式祭祀天地四时，用遥祭的仪式祭祀名山大川，又普遍地祭祀了各路神祗。
他收集起公侯伯子男五等侯爵所持桓圭、信圭、躬圭、谷璧、蒲璧五种玉制符信，选择良月吉日，召见四岳和各州州牧，又颁给他们，舜去东方巡视，到泰山时，用烧柴的仪式祭祀东岳，用遥祭的仪式祭祀各地的名山大川。
接着，他就召见东方各诸侯，协调校正四时节气、月之大小、日之甲乙，统一音律和长度、容量、重量的标准，修明吉、凶、宾、军、嘉五种礼仪，规定诸侯用五种圭壁、三种彩缯，卿大夫用羊羔、大雁二种动物，士用死雉作为朝见时的礼物，而五种圭璧，朝见典礼完毕以后仍还给诸侯。
舜向诸侯们普遍地陈述治国之道，根据业绩明白地进行考察，根据功劳赐给车马衣服，舜开始把天下划分为十二个州，疏浚河川，规定根据正常的刑罚来执法，用流放的方法宽减刺字、割鼻、断足、阉割、杀头五种刑罚，官府里治事用鞭子施刑，学府教育用戒尺惩罚。
因灾害而造成过失的，予以赦免；怙恶不悛、坚持为害的要施以刑罚，这时三苗在江、淮流域及荆州一带多次作乱，这时舜巡视，便把驩兜流放到崇山，以便改变南蛮的风俗，把三苗迁徙到三危山，以便改变西戎的风俗，舜的所作所为，天下悦服。
然而天有不测风云，舜在位后期，洪荒之中发生暴雨水灾，而且灾祸越来越严重，这次倒不是龙族在兴风作浪，而是真正的天灾，舜对此道却是不甚精通，不得已之下，便将治水重任交予人族另一位大贤，鲧。
这鲧的父亲是颛顼帝，颛顼的父亲是昌意，昌意的父亲是黄帝。鲧当初都是名满人族，是争夺人皇之位的有力人选，可惜后来他们都给挚做了大臣，结果帝尧成为人族共主后，他便被罢黜了。
鲧幼时曾淂神人传授，习得一身本事，自从接到治水之大任以后兢兢业业，劳心劳力，然而鲧即使再强，区区一人之力又岂可拦得住这无匹的洪灾，即使人族聚集在一起群策群力也也扛不住这可怕的天灾。
不过，鲧对此事还是义不容辞，在得到帝舜的授命之后，鲧便收拾行装，会同众人一起前去治水，鲧采取拦堵之法，利用女娲娘娘造人之后留在人族的息壤，制造堤坝、大山迫使黄河大水归位，又拦江蓄水，让百姓农业有了灌溉之源。
虽然短暂地平息了水患，但终究不是长久直接，十年之后，水患再度爆发，而且比之前的还要凶猛，人族一时间，损失惨重，而鲧也因此被帝舜给斩首示众。
鲧死后，尸体中诞生一婴儿，为截教大弟子多宝道人所救，多宝将禹交由鲧的妻子抚养，而禹在知晓自己父亲之事后，决心为父一雪前耻，平定水患，于是东奔西走，寻找治水良策。