以艾万年为后军都督府左都督，以正一品武职。
王朴为都督同知，从一品武职。
新设五军军法处，专管各部官军军纪，以虎大威为左都督，正一品武职。
以祖大弼为都督同知，从一品武职。
新设五军军资处，专管各部官军物资军械补充调配，以尤世威为左都督，正一品武职；
以陈永福为都督同知，从一品武职。
以白光恩为都督佥事，正二品武职。
对皇帝的安排感到不满的就是这批将领中的少数人。
有些人本以为自己率部参与了灭国之战，最后会有勋贵职位的赏擢，没想到却只是得了个不能世袭的高品武职，所以暗地里都是牢骚满腹，觉得皇帝亏待了自己，但事实已经摆在眼前，再怎样也只能乖乖听命行事。
在大军云集的辽东，尤其是以勇卫营、秦军、京营等朝廷新军为主的现在，不管是不是心里有刺，都得忍气吞声服从安置，就连祖家这样的地头蛇都不敢说个不字，其他人谁还敢公然抗命？
在安排完一众旧有军将后，接下来就轮到新生代年轻将领登上历史舞台了。
以李重进为征虏将军、沈阳总兵，率四千骑兵、三千步卒留驻沈阳，负责沈阳城周边防御的同时，定期与松原等地驻军联络出兵，征伐东北方的后金残余。
以马祥麟为镇北将军、归化总兵，率七千骑兵、三千步卒，择机向归化城(呼和浩特)进发，在收复归化城之后留驻当地，等待朝廷由山西、延绥等地组织受灾严重的农户北迁，修筑重建归化城的同时，在周边开荒拓田，将归化城建成大明北境屏藩重地。
这一决定也是朱由检经过深思熟虑后作出的。
归化城是一座塞外名城。
隆庆六年(1572)，驻牧于土默川的蒙古族首领阿勒坦汗召集各族能工巧匠，模仿元大都，在大青山之阴，黄河之滨，破土建设具有八座楼和琉璃金银殿的雄伟美丽的城池。该城竣工后，明廷赐名为“归化城“。
它北枕巍峨起伏的阴山山脉大青山，可通北部丰美的草原；南临波涛滚滚的黄河水，与鄂尔多斯高原隔河相望；东连连绵起伏的蛮汗山；西连河套，为西进甘宁之门户。
归化城坐落于黄河、大黑河冲积而成的平原上，这里土地肥沃，地形平坦，灌溉便利，地理上称为前套平原、土默川平原，史称敕勒川丰州滩。
而在此之前，塞外草原上还没有一座像样的城池，广袤无垠的草原上，大小数百个蒙古部落、数以百万计的蒙古人，都是过着逐水草而居的迁移生活，仅从这一点上看，阿勒坦汗也算是一位颇具战略眼光的奇人了。
丰州滩这种好地方不能浪费，就近移民开荒最合适不过，马祥麟带着步骑一路横扫过去，残余的蒙古各部投降的就收留，反抗的就消灭。
没了后金这个较为强力的割据武装组织，一盘散沙的蒙古部落明智的都会依附大明。投靠强者对他们来说再正常不过，谁能让自己和族人过上好日子就跟谁混，这又不是什么羞耻的事。
到时候汉人种田，蒙古人放牧牛羊，大家一起唱唱山歌和蒙古长调，晚上喝点马**酒，喝醉了围着篝火手拉手跳舞，情投意合的男女滚个草垛子什么的，这幅画面多美丽。。。
再下去个几十年，就是书同文、语同音，各民族一家亲的局面，有归化城为屏障，有骑兵和步卒重火力掩护，北面谁还能翻得了天？
马祥麟忠诚勇猛，骑射无双，适合带着大队骑兵驰骋在广阔的草原上，让他去北境建功立业，将来再论功提拔升擢，也算对秦良玉的一种变相回报吧。
朱由检真正的目的想给马祥麟封爵，世袭爵位，与国同休，开疆拓土之功才能有封爵的机会。
秦良玉的大都督一职是荣衔和虚衔，也是朱由检对这位女中豪杰的褒奖。
由于战功的问题，他没有给年过六旬的秦良玉封爵，而是将爵位留给了她的儿子马祥麟，相信以秦良玉的头脑不会看不出自己的良苦用心。