接到中将自杀恕罪的消息后，其余荷舰陆续向明军投降，于是，截止到当天夜幕降临前，荷军第3舰队的主力船团可以说是已经全军覆没了。
是役，明军主力舰队仅有2艘军舰重创、3艘军舰中创、400余官兵伤亡，却一举打垮了拥有34艘专业海军军舰的荷兰舰队主力----击沉击毁其中军舰5艘、俘虏另外27艘，并毙俘荷军水师官兵4000余人，但却让2艘在战区外的荷兰双桅信报船逃走了----为大明在第二次明荷战争获胜奠定了坚实的基础。
由于淡美兰群岛海战结束时，天色已晚，所以明军软帆船队并没有立刻赶赴海峡战场，而是押解着各艘被俘船只，先向400公里外的新邾港驶去，结果，当晚，又有两艘受伤较重的荷兰船在风浪中沉没。
此外，还有两艘受损程度较轻且人员大部幸存的荷兰军舰趁着夜幕中明军舰船视野不良、无法观察到异动的机会，解除了上船看管投诚俘虏、简单操作船只南行的明军水兵的武装，然后挂上备用白帆----在战斗中，面临明军炮火时刻威胁的荷军各舰根本没机会悬挂备用帆，而且就算挂上了，很快也会被明军发射的炽热弹给再次焚毁----悄然的向西溜走了。
十月五日天亮后，发现有两艘荷兰军舰裹挟上船明军水兵逃走的明军主力舰队便以5艘受损情况较重的软帆船和另外5艘几乎完全没有损失的软帆船继续押解荷兰舰队残余舰船前往新邾港，剩余8艘主力舰则扬帆驶向新南安湾方向。
其实宁虎并不清楚昨天淡美兰群岛之战爆发之际，郑家水师主力已经在新南安湾打了一场酣畅淋漓的大胜仗，甚至也不知道之前已经有过所谓的第一次新南安湾之战，更不知道荷军陆师一部已经登陆坦宾岛的消息，之所以他派遣潘龙和率领8艘软帆船前往新南安湾，是为了联络直接联系郑芝龙，以便与郑家水师残余力量汇合，进而发起对荷军残余舰船的打击。
结果等到潘龙和部于当年十月六日下午驶入新南安湾南口时，却差一点与郑家主力舰队爆发了一场自相残杀，好在，双方及时注意到了对方悬挂的旗帜，这才避免了一场无谓的战斗。
随后，潘龙和亲自过船来到郑芝豹座舰上进行了交流，等双方把各自战胜的消息进行汇总后，这才发现荷军第3舰队已经折损了一半以上的力量----实际荷军只剩下了2艘巡航舰和38艘武装商船----并且作为中流砥柱的荷兰专业海军编队也不复存在了。
既然荷军已经只剩下了空壳，潘龙和自然希望自己与郑家水师主力能联兵追击，但郑芝豹却以郑芝龙被包围在了新南安城内，目前城外荷军陆师正疯狂进攻为由，主张先组织水兵上陆击破坦宾岛上的荷军，再出海打击荷军残余舰船······