作为异变初期的分层期，指的是花园最外边缘开始出现杂草蔓生的情况，并逐渐侵占了原本生长在这里的美丽花卉的空间。随着观赏花卉的面积不断被蚕食，出现了名为“园丁”的巨大生物，由于大小差异过于悬殊，黑实验室没有观测到园丁的全貌，但是从它踏入草丛里的脚推测，园丁应该是类似人族的生物，于是将这里命名为巨人的花园。
那时候，纳什尔还未诞生，并不了解太多细节，只是听一些实验员提起过。当时他们很担心实验基地会被园丁发现，不过后来一直都隐蔽得很好，双方相安无事，也就渐渐放心了。
总之，可能是意识到那些娇贵的花朵无法与生命力顽强又能不断散布的野草竞争，园丁自发地缩小了花卉的种植面积，转而在两者之间批量栽种了一些奇特的植物，也就是伊流翎他们先前在中间区域看到的那些既不能算是观赏花卉，又和外围区域的杂草不一样的植物。
这些植物同样拥有很强的生存能力，并且能够与杂草竞争性生长，即使后者将草籽撒过来，也无法在前者扎根的区域萌发。同时，这些植物本身又属于比较“保守”的种类，并不会因为生长茂盛就向四面八方蔓延，因此不会再去侵占花卉的生存空间，这才拦住了那些蔓延的野草，也彻底让南方花园变成了三层结构。
分层区的异变也就这么点儿，没什么大碍，而且当时的黑实验室还能够继续与外界互通，时常派人出去进行物资交易什么的，完全也不在乎周围的环境变化。
“遗忘阶段的影响就比较大了，你们应该也见到过外围的竹节人了吧？”纳什尔说，“它们的出现，就标志着这片空间开始正式诞生自己的规则了。”
早期这里是不存在竹节人的，那时候在外围区域活动的主要是虫子，而在每个虫群中，都会有几只很特殊的个体，它们不知道通过什么方式得到了南方花园的眷顾，拥有了一种特殊的能量。凡是听到这些虫儿鸣叫或者振翅的声音的人，记忆就会被逐渐抹消，而虫子的第一批受害者，正是某次外出采买物资的一个实验室员工，他也是最早的竹节人。
当然，这虽然很麻烦，但也在实验室能控制的范围之内，一旦发现了竹节人的机制，想避开就不是难事。而且，竹节人的来源只有实验室员工，后者又都在避免与虫子接触，所以根本无法达到能形成部落的规模，算不上什么大威胁。
但几乎也就在那个阶段，实验室内部发生了厉鬼暴乱事件，搞得他们焦头烂额，不得不冒险去外界偷取囚魂锅建造了火坑，又制造了纳什尔这个智能体来管理实验品。等忙完这些之后，他们惊讶地发现，通往外界的通道，不见了。
从这时起，南方花园变成了一个完全封闭的空间，开始进行它迈向绝地的，本质性的蜕变。
假想阶段，开始了。