大西洋和太平洋的水位是有差别的，巴拿马的地形也有差别，就需要船闸来提升水位，要不然船只不能航行。
原先有各种小湖泊化解这种水位落差，但只能行走一些木头帆船或者小型蒸汽机船，因为水位要求不高，现在需要能通行万吨战舰，就需要船闸了。
船闸的宽度足足有三道分开式的宽三十多米，宽二十多米，宽一百米的船闸，可以允许不同宽度的船只通过，李亚他们听过张强讲过巴拿马船闸的构想，来了以后就一步到位，直接上一百米宽度的船闸，虽然技术比较原始一点，通行复杂一点，但能用多年，估计用到下一个世纪或者几个世纪都可能，一劳永逸。
这个工程就比张强后世英国人和西班牙人，法国人开凿巴拿马运河的时候的设想庞大多了，因此用时用工都比较多，可再多他们也只是花钱投入，需要计算成本，而新秦国的成本只有工具和物资材料成本，人力成本实在太多了，那时候整个巴拿马运河花费十年时间用工才三十万人，现在李亚，庄林他们初期花费一两万人，加上自有的新兵部队，清理河岸，用时一年时间。
后来用工十万人挖掘河道，初步清理了河道地下的礁石和一些淤泥，等于是粗线条的构建了一个运河的大致轮廓，后来停工半年时间打战，有了俘虏以后用工三十万人，主要精力集中在科隆港大西洋入口处到加通湖那一段河道的拓宽改造上，分十万人疏通加通湖各个支流和湖中心的那些河道里面的淤泥，挖掘深度达到了十二米之多。
之后用工五十万人到七十万人，一边打战，一边挖掘和建设第一段的船闸，用时一年半时间。
之后集中了一百二十万人全面疏通了河道，挖掘河道深度达到了五十米中心，大约五百米宽度以后，两侧挖掘大约四十米深度，再像岸边退到达了三十米到二十八米的深度，在到岸边的引流渠道，深度十二米或者百米，这是加通湖的湖面上，靠近南岸的部分，其他地方也基本上在二十八米深度。
占领了巴拿马城以后，通往太平洋这一段的河道也仿造了大西洋入海口的地方的河道挖掘，用时半年时间突击就完成了，三座船闸落成，现在基本上通行这个世纪的所有大型船只已经畅通无阻了。
于是二十万人西班牙人俘虏被释放。