因为氪石装置阻挡了超人的视线，他没能意识到爆炸装置的存在，所以没能阻止爆炸的产生。
加上人们对超人的质疑……
这一切，动摇了超人对自己的信念，于是心灰意冷。决定退出。
超人消失。
国会爆炸令蝙蝠侠越发认为超人是个威胁，坚定了他干掉超人的信念。
通过此前行动留下的追踪器，他闯入氪星飞船，从卢瑟手中抢走氪石。
卢瑟毫不意外。
一切都在他的掌控中。
镜头下，他逐渐展示出了自己的野心。
走进氪星飞船深处，用聪明的头脑，掌握了氪星科技，并决定利用氪星人，佐德将军的尸体，制造某种武器。
与此同时。
由于超人消失和国会爆炸案的发生，火上浇油一般，人类社会对于超人的反叛情绪越发高昂。
新闻报道。
“我们都很想知道，超人是不是事先知道危机，却袖手旁观，他跟这场国会惨案究竟有没有关系……”
“他的消失引起了不小的质疑，他怎么会消失？目前，这个国家正前所未有的需要他的出现。”
另一边。
蝙蝠侠开始锻炼自身。
镜头给到了，蝙蝠侠对蝙蝠战甲的研究，编号一晃而过。
观众却清楚的捕捉到其代号。
【反超人战甲】
显然，他击杀超人的想法一直都很坚定。
这时。
露易丝通过某些线索，追查到了卢瑟身上。
卢瑟派人抓住了她。
危急时刻，超人终于出现，拯救了露易丝。
但是。
卢瑟抓住了超人的母亲，玛莎，以玛莎的生命作为威胁，逼迫超人与蝙蝠侠大战。
二人原本稍稍平息的矛盾再度凸显。
……
“玛莎？”
人们总算意识到了问题所在。
超人和蝙蝠侠的母亲是一个名字。
从现实的情况来看，超人和蝙蝠侠是战友，所以，无论他俩在电影里打得有多激烈，最后一定会重归于好。
显然，玛莎，这个名字就是契机。
……
“好吧，你来了！”
屏幕上，蝙蝠侠和超人的战斗已经开始。
蝙蝠侠几乎没有任何还手之力，他的全部设计，全部心机，用在超人身上，作用都等于是零。
超人真的像是人间之神，无所不能。
场景中。
大雨哗啦而下。
夜空下的战场，哥谭的废弃港口，四处都是冲天的火光。
砰！
超人一拳把蝙蝠侠砸到另一栋大楼的楼顶。
蝙蝠侠动用了氪石制造的武器。
超人的能力被无限削弱。
二人拳脚相交。
这彻底激发了超人的怒火。
一方面，母亲正被坏人威胁。
另一方面，他能感受到蝙蝠侠对自己的恶意。
解释毫无用处。
但蝙蝠侠毕竟开挂了，他利用氪石打赢了这一战。
在蝙蝠侠即将杀掉超人的时候，超人喊出了“玛莎”的名字。
“他这是在帮他杀掉玛莎。”
……
这一段剧情并未脱离观众的预料。
正如他们所想的那样，二人矛盾消失，蝙蝠侠帮助超人拯救玛莎，超人则前往氪星飞船，要干掉卢瑟。
剧情进入最后阶段。
卢瑟利用氪星科技，用氪星人佐德将军的尸体，加上自己的血，制造的氪星怪物，也即是毁灭日，就此诞生。
双方大战。
超人几乎没有任何还手之力。
整个城市都成为了他们的战场，大楼坍塌，场面犹如此前众人经历过的纽约大战。
超强的能量波扩散，整个城市的人民都遭到威胁。
双方的战斗从地面打到太空。
人们动用了核弹。
巨大的火光让幽深的夜空宛如白昼。
然而。
毁灭日在这核弹的能量下变得越发强大。
超人身躯干瘪，漂浮在太空。
在太阳的照射下，好半晌又恢复过来。
蝙蝠侠入场，认出毁灭日是氪星造物，打算用氪石武器击杀毁灭日。
关键时刻，神奇女侠登场。
正义联盟集结。
三大超级英雄，蝙蝠侠、超人、神奇女侠，大战毁灭日。
三人都意识到，要杀死毁灭日，只能依靠氪星武器。
就是蝙蝠侠此前意图干掉超人时，所制造的那把镶嵌着氪石的标枪。
超人决定牺牲自己。
奋力一击，高举标枪，冲向毁灭日。
就此。
超人牺牲了自己，干掉了毁灭日。
超人用自己的死，换回了人们的信任。
最终，卢瑟被捕。
所有人都意识到，这一切对立，都跟卢瑟有关，包括将人类和超人彻底推到对立面的国会爆炸惨案。
电影进入收尾阶段。
蝙蝠侠和神奇女侠站在超人坟前对话。
蝙蝠侠决定找到一些拥有超凡力量的人类组建起一支队伍，迎接必然会继续出现的危机。
观众们意识到，这是正义联盟的前奏。
蝙蝠侠决定集结起一支队伍。
这不是正义联盟是什么？
观众们见到这一幕，鸡皮疙瘩都起来了，这是真切的幻想照进现实。
现实世界，正义联盟已是真实存在。
突然。
他们联想到电影中的超人。
一帮人瞪大眼睛。
难道超人快出现在地球了？
对话结束。
屏幕一黑，彩蛋浮现。
画面中，超人的棺材即将被掩埋，露易丝离开之前，洒下一把土。
镜头推移。
尘土抖动。
唰！
屏幕变黑，电影结束。
“超人会复活？”
大家都意识到彩蛋的意思，显然，超人棺材上抖动的尘土，代表了超人肯定会再次出现。
……
约翰·克勒眉头一动。
这就是隐喻了。
结合电影中的超人之死，联想到安东不久前曾说的，超人即将归来……
意味深长。