朱佑樘也沉默了，他虽然知道情况不太好，他也在努力的改变这种情况，而且是呕心沥血，可是没想到情况居然糟糕到了这样的地步。看了一眼儿子，朱佑樘又觉得很欣慰，自己这是后继有人了，想了想，朱佑樘开口问道：“那你想到什么办法了吗？”
“这天下终究是士人治理的，大明虽然不是与士大夫共天下，可是时至今日也差不多少了。”
“咱们父子二人终究是在这紫禁城里面，能惩处多少人，又能杀了多少人呢？想做又能做多少？既然你看到了，你觉得不公，那你觉得该怎么办呢？”
朱厚照看了一眼朱佑樘，父子二人都没提牟斌，可是父子二人都知道，朱厚照已经在为牟斌求情了，而朱佑樘也听进去了。朱厚照刚刚说那些话，朱佑樘也听进去了，朱佑樘现在问的就是如何一劳永逸的解决这个问题，这才是为君之道。
朱厚照知道，前面自己说了那么多，如果拿不出来一个全局性的办法，老爹会失望的，自己谋一域之后，到了谋全局的时候，这才是帝王该有的胸襟。
至于叶家的事情，或者说叶淇的死，朱佑樘并未看在眼里面，别说一个退了的户部尚书，在职的户部尚书又何如？皇帝想收拾一样收拾，朱佑樘想看到的是儿子的办法，不是发泄，不是对整件事情抱怨，而是如何解决眼前的事情，无论王道还是霸道，行得通就是好道。
“儿臣觉得首在吏治，完善监察制度和整饬吏治刻不容缓，裁汰老弱昏官，严惩贪腐，懒政怠政一律严惩不贷。”朱厚照看着朱佑樘说道。
“朝廷有都察院，各道有监察御史，六部有清吏司，内廷还派了守备太监，可是吏治还不是这样？”朱佑樘摇着头看向儿子，开口问道：“吏治自古以来都是大问题，每一个帝王都想要解决吏治，都想要吏治清明，可是又有多少人能做到？“
朱厚照摇了摇头，然后开口说道：“父皇，朝廷虽然有很多的监察衙门，可是官官相护啊！再说了，这些人如果也贪污了，那怎么办？就像这一次的扬州一样，各地的守备太监，不是儿臣看不起他们，他们不是那些文官的对手，还是要另想办法。”
听到儿子这么说，朱佑樘也来了兴趣，笑着问道：”那你有什么办法？说来听听。“
“官员最了解官员，官员也最清楚官员，儿臣想推出秘本制！“朱厚照没有丝毫的犹豫，直接将自己的想法说了出来，事实上秘本制就是清代的密折制，这个制度在清代发展到了巅峰，甚至连立皇储都是密诏立储制度，将册立皇储的密诏藏于乾清宫正大光明的匾额后面。
清朝入关之初，沿袭大明旧制，官员有事报告皇帝，公事用题本，私事用奏本。
题本盖印，奏本不盖印。题奏本都由通政使司进呈，在皇帝阅批之前，内阁大学士已经“票拟”过。因此，这两种文书都是公开的，不利于下情上达。其次，题本办文程序太繁，运转速度十分迟缓，而且由于经办人员过多，容易造成泄密，使皇帝实施政务受到很大限制。