当时他在国内吃了个败仗，不得不远遁避祸，于是选择了去吕宋跟西班牙人争夺统治权。
万历二年冬，林凤率领战舰六十二艘，水陆军人各两千，妇女一千五百人以倭人庄公为统帅，引舟南驶，到达伊鲁果思（IIocosSur）时遇到一艘西班牙小舟，林凤就命令手下的兵士抢夺小舟。但是被驻守在当地的西班牙人所发现，迅速的报告给了米岸（Vigan）的军官撒施洛（JuanSalceds）。
撒施洛立刻派三个土著前往马尼拉示警。但是土人中途被林凤的手下截获了。林凤于是就趁机进攻米岸，撒施洛带领西班牙驻军五十人逃跑。林凤趁胜追击，前往马尼拉。
万历二年十一月二十九，林凤的水师到达了马尼拉的港口马雷维里斯（Mariveles）。黄昏时林凤命部将庄公带领六百人乘小船前往进攻马尼拉，中途遇到了暴风雨，有二百多人由于小船倾覆溺水而死。但是其余的人仍旧在庄公的带领下潜至马尼拉南八哩的巴拉维克（Paranaque）登陆，并于第二天凌晨到达马尼拉。
当时西班牙军官戈依第（MartindeGoiti）驻防城外，仓促间没有准备，庄公很快就将其击败，夺了他的地盘，戈依第本人也临阵战死。城里的守军就乘此机会加强了守备，等到庄公进攻时，他们开始拼命抵抗。
而庄公的兵力本来在进军途中遭遇暴风雨已经折损了二百多人，所以仓促间并不能够攻下城垣。于是庄公就退至甲米（Cavite）和林凤汇合。
同时另一方面，西班牙人的总督拉维萨丽思（Lavezaris）一等庄公退兵，就立刻沿马尼拉湾筑起高墙，置兵防守。撒施洛也率领战舰六艘、兵员数百名而来助战。
林凤第一次进攻完成以后，菲律宾的土著以为是明人取得了胜利，迅速在马尼拉附近集结了近万人，开始对西班牙人有所动作。
十二月十三，林凤发动了第二次进攻，他命令庄公率领一千五百人，兵分三路发起进攻，林凤自己的战舰也在港外发炮助攻。
但是由于西班牙人加强了城垣和增添了援兵，急切之间没有拿下。林凤又发五百援兵，但是终是无功而退。
在林凤的军队攻打马尼拉时候，菲律宾的土著击杀传教士以及商人兵士等，准备策应林凤的海盗军，但是在林凤失败后迅速溃散。
林凤的海盗军失败后就引军北航，从阿峨河（AngoR）退至彭家丝兰（Pangasinan），于河上四哩的地方因地筑城，建设炮台作为长久之计。并且下令当地土酋助饷——很有天朝圣使的气派。
西班牙的总督拉维萨丽思探知这一消息后，心怀忧虑决定将菲律宾的西班牙兵力齐集马尼拉，准备攻打彭家丝兰，以撒施洛为统帅。
撒施洛以菲律宾兵六千人，西班牙兵六百五十人，先驶往彭家丝兰北部的林葛荫湾。当时林凤的兵船有三十二艘停泊在那里，由于没有什么防备，全部被歼灭，于是撒施洛举兵登陆。
在此处，两军混战四月有余的时间，林凤又因为是在大明国内吃了大败仗而临时决定来吕宋的，因此缺乏补给，并最终不敌。于是突围出走，有一部分逃至山中。
林凤在菲律宾兵败以后，走投无路，又引兵内犯。曾到达柘林，靖海，碣石等地。同时也到达过福建等处，依台湾魍港为基地四处劫掠。
但是当时福建方面打击海盗很严厉，又开始开海通商，许多以前暗中支持海盗和纵容海盗的“海商”们都变了脸，不再给于支持，林凤由是四处碰壁，只得离去。
这种时间过了几年，林凤的部众开始不满起来，麾下主要头目们很多都生起了别的心思，到了高思棠来之后，林凤本人已经感到部下的不满而悄然离去，然后便发生了公推福建沿海海盗总舵主的事。
高思棠通过私港海商得知了这一消息，暗中谋划，终于在高务实取得清化、兵进英都府的那个时间点和海盗联军交了手。
由于早有准备，且高思棠严格执行了高务实的远程炮战之战术，这场海商VS海盗的战斗在连打了十一日(包括寻觅、接敌、战斗、追击、围剿)之后，终于彻底取得胜利。
高思棠的京华泉州舰队和海商联军一共击毁、俘获海盗船一百三十二艘，俘获海盗四千二百六十七人，妇女一千四百九十三人，老幼一千三百七十五人，击杀海盗……呃，这个没法统计，因为有很多落海、溺毙(受伤落海以及没法长期漂浮大洋之中)等。
其自身付出的代价不能算小，合计损失了三十九艘海船，包括京华的制式武装运输舰五艘——这就是差不多三十万两银子的损失了。
但是，这仍然是一场辉煌的胜利！因为从此以后，福建沿海绝对不会再有什么海盗敢打京华的主意。
而且在战后的清点之中，高思棠在海盗的老巢之一，台湾魍港发现了高务实三番五次下令搜集的东西——所谓“番外高产粮食”中的两种。
根据分辨，高思棠断定，这两种东西可能都是林凤当年在吕宋获得的，只是……他虽然也拿回去在新的老巢开始种植了，却谈不上很认真。
这两种作物，按照老爷的说法，应该就是“番薯”和“玉米”。
泉州私港的庆功宴，就是为击败海盗联军和获得两大作物而举行的。
高思棠兴奋异常，他觉得“王旁单名”已经在向他招手了！
他终于要进入老爷的心腹亲信行列了！
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这一章四千字，由于剧情实在是合在一起的，我想了想，就不拆分开来再发了。