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回到洪荒之中，帝俊与太一便朝着妖族大军而去，而其余诸圣便各自返回了自己的道场，女娲也回了娲皇天，并没有随帝俊一同看望残余妖族，如今她的心思都放在了仅剩一道残魂的伏羲身上，哪里还有空顾及后面妖族的安排。
残存的妖族数量不少，但金仙及其以上修为的妖族却已经十分少了，如今远古星空和洪荒北部烟瘴之地皆归了妖族，至于如何安排，帝俊心中已然有了决议，而且除了这两处地方之外，还有鲲鹏的老巢北冥之海，帝俊也同样没有忘记，那本就是妖族之地。
在帝俊的安排之下，白泽带领一小部分妖族精英以及洪荒大地之上的妖族前往洪荒北部烟瘴之地休养生息，而计蒙这带领一部分适合海洋生存的妖族前往北冥之海休养生息，而剩余的大部分妖族皆迁往远古星空，以期他日妖族东山再起。
妖族分居三处，为保证传承不断，帝俊又再次炼制出了两座万灵阁，安放在洪荒北方烟瘴之地以及北冥之海，用以妖族传承，此二处皆已白泽、计蒙为尊，用以培养优秀妖族后代，为日后妖族东山再起积蓄实力。
而远古星空之中，妖族分居与周天星辰之上，万灵阁则又被安置在了紫微星上，帝俊、羲和、太一、万灵以及刚从娲皇天归来的陆压、望舒皆住在了紫微星上，就连常羲也时常过来与羲和相聚，而作为周天星辰之首的日月二星虽好，但却实在不太适合居住。
从此，巫妖两族尽皆隐退，再无昔日君临洪荒之凶威，而巫妖隐退之后，以致洪荒大地之上立时空出了无数地盘，除却一些野兽之外，再无其他生灵，如此便给了人族最好的发展空间，虽然日后那些野兽也同样会成为妖族，但对人族却也没有太大威胁，人族一下子进入了高速发展时期。
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昊天和瑶池来到天庭之后，看着天庭一副残败景象，眼中也闪过一丝无奈，这全都是因为巫妖之战造成了，以他们的力量想要修复天庭，实在太难，好在这时天道之力降临，天庭瞬间便恢复到了原来的模样，这让昊天与瑶池大喜，直朝天际叩拜，感谢鸿钧。
随后昊天和瑶池便开始发展起了天庭，瑶池将先天五大灵根之一的壬水蟠桃树种在了一处院中，壬水蟠桃树分化三千六百株，那便是日后的蟠桃园，这蟠桃园所结之蟠桃也成了天庭一大特色，可增长仙人修为，自然吸引了无数洪荒散修。
昊天与瑶池入主天庭之后，便主要将目光放在了洪荒散修一脉以及人族身上，洪荒散修一脉自红云之劫之后便已然没落，而人族更是毫无底蕴可言，而且他们与诸圣、妖族都无干系，自然是昊天与瑶池拉拢的最好对象。
随着人族在洪荒不断扩张，天庭不断吸纳散修一脉和人族仙人，一个新的时代逐渐降临洪荒之中。