另外就是秘书丞王凌，本来他也该与王允长子、侍中王盖享受同样待遇的，只是由于尚书令士孙瑞事先得了皇帝吩咐，出面保下他，这也算是让王凌远离了这场风波。
有了黄琬、赵戬与王凌的例子，足以表示皇帝不愿将王氏党羽连根拔起，于是朝中人心渐渐平复下来。
以皇帝洁身自好的性格，自然不会亲自下黑手翦除于国有功的重臣，他在事先下发口谕令太尉马日磾与前将军赵谦负责此事后，便一清早就摆驾出城前往上林苑，提前开始了准备在月底才进行的演武。
这次演武由羽林、虎贲、北军五营、还有宫中兵卫参加，一共有一万七千余人，步骑兼备，弓弩强劲，单论气势，就足以称得上是一支精兵。
在拿出从郿坞缴获的财物犒赏三军将士，各有提拔之后，众军士气高涨，将校拥戴，迅速将李傕等十万大军压境所带来的不利影响给消除到最小，并且稳定了军心。
等到身在上林苑的皇帝处理完了军中的一切，得到马日磾命尚书台下诏对付王允的消息后。他立即连夜赶回长安，做出一副毫不知情的惊愕模样，但这时候王允党羽早已尽数入狱，诏旨已发，不可追回，只得默认事实。
一场自董卓死后便引发的朝堂争斗，终于在这两天尘埃落定，胜负立分。
王允倒台，朝廷在皇帝的主持下开始论功行赏，以前将军赵谦为司徒、与太尉马日磾并录尚书事；以光禄大夫杨彪任光禄勋，顶替了南阳人邓渊，为皇帝掌握郎卫；其后又迁廷尉正法衍为廷尉，专司王允案。
不久朝廷又调整官吏，将光禄勋属下羽林、虎贲两支郎卫分割独立出来，成为与北军五营一样的编制军队，各自扩充兵额，共六千人。同时也分离出了谒者台，将谒者台正式从名义上获得与御史台、尚书台等同的地位。
这样做一来扩充了军队，方便将羽林、虎贲直接归皇帝掌握，另外也能提高谒者仆射杨众的地位，算是变相的酬功于杨氏。
最后诏拜征西将军皇甫嵩为车骑将军，并以其为主，北军中候王斌、羽林中郎将徐荣等人为副，统率长安各军负责守卫城池。赵谦为表支持，主动将手下四千益州叟兵交了上去，这支叟兵是由叟人组成的军队，以勇敢善战著名，曾借此镇压白波黄巾。
这样再加上皇甫嵩手下两千余人，建义中郎将段煨手下万余人，以及护羌校尉杨儒招募的三千新兵、荀攸与皇甫郦前往左冯翊以财物说来助战的数千羌胡义从，长安可勉强拉起一支将近四、五万人的队伍。
此事过后，还引起一阵余波，长安市民在甫一开始听到王允被捕入狱后，在有心人的挑唆下舆情纷扰，险些闹出事端。
皇帝为了安定城内百姓，命京兆尹司马防内松外紧，逐一排查，在处决了几个寻衅滋事的恶徒、以及秘书丞王凌改任长安令现身说法以后，长安才逐渐开始安定。