幕僚、参谋们苦劝无果，反到是大山岩以司令官的身份，命令他们离开，尽可能自己想办法逃过鸭绿江去，而这时枪声愈密，因此幕僚、参谋们也不敢在九连城里久做停留，只得从九连城里撤离，向窑沟的方向撤退，当然也有一些幕僚、参谋愿意留在下陪着大山岩一起殉城。
而人民军杀进九连城中，基本没有遇到什么有力的抵抗，一来是九连城里的日军并不多，二来日军的斗志也不高，因此像辽阳城中那样的顽强抵抗，根本没有出现，因此人民军于6月6日凌晨1点，完全占领九连城，并在日军司令部里发现7、8具尸体，其中有一具尸体身穿的制服与其他人大不相同，至少是将军级别，死因是太阳穴被击穿，手里还握着一把手枪，证明是自尽身亡，而且俘虏辩认，确定此人就是日本满洲军司令官大山岩元帅。
就在人民军占领九连城的时候，日军的南线防线也全线溃败，其实被装甲部队撕开了缺口之后，日军防线的崩溃也就是迟早的事情，因此负责守卫南线的日本第2军团司令官奥保巩大将和参谋长落合丰三郎少将协商之后，也果断下令，从战场撤离，向窑沟方向撤退。
而就在日军撤退时，人民军也趁势随后掩杀，不仅大量的杀伤杀死日军，而且还俘虏了不少日本士兵以及日本的后勤人员。
到凌晨4点的时候，人民军又收到好消息，原来第3军攻破了凤凰城。人民军对凤凰城的进攻发动时间最早，而守卫凤凰城的日本第4军团只有不足4万的兵力，不过日军在凤凰城准备的时间较长，构建了比较完善的防御体系，这就给人民军的进攻造成了不小的困难。
另外于凤凰城远离主战场，九连城这边的失利消息很晚才传到凤凰城，结果让凤凰城的守军能够在较长的时间保持较高的斗志，这也自然增加了人民军进攻的因难，好在是第3军有自行火炮和牵引火炮这两张王牌，因此靠强大的火力，硬是一点一点的攻克日军的阵地，结果激战了大半夜，才算是突破了日军的防线，第4军司令官野津道贯和参谋长上原勇作带领败军，向东撤退，而在半途又遭到攻占九连城的人民军袭击，被打得几乎全军崩溃，野津道贯和上原勇作在少量精锐部队的保卫下，趁着夜色才从战场上逃离。
连续攻占了九连城、凤凰城之后，人民军也基本锁定了胜局，不过这时战争并没有完全结束，毕竟日军的人数太多，即使是后勤人员，也接受过一些基本的军事训练，因此在被日军被击溃之后，建制也彻底被打乱，剩余的日军、后勤人员自觉不自觉的分成数十个小团体，各自为战，战场也呈现出碎片化的局面，极为混乱。
由于是在夜间作战，既使人民军有无人机和先进的通迅设备，也难以保证对战场的全面控制，而且经过了激烈的战斗之后，人民军的编制也有些乱了，另外武器、弹药也消耗了不少，因此罗岳决定暂时停止战斗，只守住几个关建的要点，而各部队就地进行整顿，重新恢复编制，等天亮之后再寻找日军。反正现在所有的桥都被炸了，也不怕日军能够飞过鸭绿江去。同时罗岳还将指挥部迁进九连城，这样也更于指挥，并且还派出大量的侦察兵，去侦察日军的动向、分布情况。
凌晨6点的时候，罗岳收到了负责北线牵制的第4军的通知，发现有大量日军在窑沟一带聚集，人数约在10万左右，并且在组织使用船只、绳索等物渡江，由于这里靠近第4军的防区，因此首先被第4军发现，不过第4军实际只有半个军，总兵力还不到4万人，不敢轻易发动进攻，于是赶忙向罗岳报告。
这时天色己经放亮了，而侦察兵也都纷纷回报，因此罗岳对整个战场的情况也有了一个基本的了解，除了窑沟之外，日军还有其他10余个聚集点，多达万人，少则也不1千余人，而人民军也都己经完成了重新整编，连攻占3凤凰城的第3军也赶来汇合，于是罗岳也分兵派将，对日军进行最后的清剿。
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