在决定出兵征剿河湖根据地之前，赵尔巽专程招见了张彪和黎元洪，因为湖北新军有征剿地方盗匪的职责，因此这次征剿行动，两人也是责无傍贷的，于是两人协商之后，表示可以出动约5000左右的新军参战，再加上其他的地方部队，总计大约可以出动10000余军队。
而相比之下河南方面就要寒酸得多了，本来清廷计划的三十六镇、十八个混成协新军中，河南有两镇一协的指标，但现在还没有着手组建，因为河南靠近北京，有北洋新军在附近，一但出了事情，清廷也可以迅速的出兵增援，因此将河南新军的编制排在后面。当然在旧时空里，河南最终只编制了一个混成协。但现在河南没有新军，只能够调集相他的地方军队，大约可以征集到7000军队。
经过了赵尔巽和张人骏协商之后，决定以湖北军队为主，河南军队为辅，湖北军队由襄阳府出兵，由南向北进取南阳府唐县；而河南军队由开封府出兵，由北向南进攻许州临颖县，当然主要是牵制河湖根据地的兵力。而所需要的军费，一部份由地方乡绅、豪强资助，一部份则是从地方的税收中抽取。洋务运动之后，地方截流上交清廷的税赋己经成为常态化了，清廷的财政主要是靠海关和商税来维持，因此赵尔巽、张人骏截取税钱充当军费，丝毫没有什么不妥的。
其实征剿的准备工作早就己经开始进行了，因此在赵尔巽、张人骏下定决心之后，军队迅速的集结，仅仅只用了20余天的时间，就分别从南北两线出发。
虽然河湖根据地政府对于击败清军的征剿信心十足，但也不敢大意，毕竟这是根据地成立以后，首次面临清廷的全面进攻，而打嬴了这一战，不仅根据地将获得长足发展，而且根据地的穿越者都将获得足够的政治资本，但如果输掉了这一战，虽然可以逃回山东去，但未来的发展空间也就有限了，但对方的兵力远在义勇军之上，因此这一战也并不好打。
现在义勇军虽然编制了三个团，但每个团都缺少重武器和火力支援武器，只配备了一个60迫击炮连，共有18门60迫击炮，而每个战斗排里，编制两门掷弹筒；另外则单独编制了一个火力加强营，分别设有一个75毫米野战炮连，配有火炮6门；一个100迫击炮连，配有9门100毫米迫击炮；一个机枪连，配有9挺马克沁机枪。无论是装备还是兵力，和清军相比，由其是和湖北新军相比，都不占什么优势。
最初开创根据地时，负责军事只有7名穿越军人，指挥官栗文飞，而随着根据地的扩大，军队增加，现在穿越军人己经达到16人，主要担任团一级或以上军官，而营一级的军官，则全部是由本土人担任。
在收到了清军的兵力和方向分配之后，栗文飞也立刻招集团级军官，协商应对的战术。众人一致认为，清军的人数虽多，但兵力却是分成南北两路，这就犯了分散兵力的大忌，因为以这个时代的通迅技术，这两路清军不可能保持通畅的联络。而义勇军则可以充份的利用内线优势，兵力的调动迅速，集中优势兵力，逐个击破，但要确定的是先打湖北清军，还是河南清军。
从清军的兵力分配和实力来说，湖北清军当然是远强于河南清军，因此有一部份穿越军人就主张应该先打湖北清军，只要是击败了湖北清军，那么河南清军自然就不是对手，说不定会不战而退。
但经过详细的分析之后认为，湖北清军还是有一定的战斗力，而且又是初次出战，因此士气不会太差，再加上兵力众多，也不容小视，如果首先和湖北清军交战，就算能够获胜，损失也不会小。不如先暂时避其峰芒，以少量兵力牵制，并且调动湖北清军，集中主力，先击败河南清军。
由于河南新军的实力弱，因此义勇军击败河南清军，也不会有太大的伤亡，而且还能靠胜利来提升军队的士气，而这时湖北清军在义勇军的牵制调动下，也差不多精疲力竭，士气消磨，而在这个时候，再集中兵力，一举歼灭湖北清军。