“把那杨积善凌迟处死，九品以上文武官员，每人割一刀，看他能挺住几时。此外，大理寺、刑部、御史台等，联合彻查余党，对杨家株连九族，但凡牵扯入谋反者，一律诛杀，在黎阳一带，接受救济、参与谋反军的刁民及家人，全部坑杀。”杨广下了杀令，顿时朝堂不寒而栗。
这一条严厉的皇命下达后，整个洛阳城牵扯进来的人，先从几千人，最后扩到三万人，杨家上下全部诛杀，弘农杨家远支还好，五服之内的近支杨素族人，全部被杀，整个杨阀遭到了巨大打击，从此除名。
朝中还牵扯到了光禄大夫赵元淑，兵部侍郎斛斯政、周罗睺儿子周仲将军、杨雄之子杨恭道、韩擒虎儿子韩世谔、史万岁儿子史怀义等人都被通缉或斩杀，洛阳和长安城内的家业都被没收，家眷统统打入死牢。
虞世基、裴蕴、来护儿的儿子也有参与，杨广卖给这几个忠心耿耿的臣子一个面子，没有动家族，只赐死了这三位参与叛乱的儿子。
所有没有缉拿到的人，统统被悬赏，朝中派武侯卫士出京搜捕，地方官衙也要张贴通缉榜文，配合缉拿。
杨广做完这些之后，有提拔一些人，将屈突通、杨义臣、陈稜、来护儿等人都官升一级，以前是将军官职，提升为大将军，以前是大将军的，就提为上大将军，又赏赐诸多黄金、财帛，留守的独孤机、段达、元文都、李浑等人，此次也立功了，都提升一职或一爵。
同时，派苏威父子到关中安抚长安的民心，又调动李渊去往弘化郡，兼知关右诸军事，防备关内西北方动乱。
“陛下，平定了杨玄感叛乱，使四海复归安定，可喜可贺，然而一些地区山贼、盗匪横行，打家劫舍，哄抢粮仓，也需要调兵清肃围剿，以防做大，后患无穷！”这时候，裴矩提出来。
樊子盖、卫文升、李景等人全都同意这说法。
杨广同意了，将一些大将军分派各郡任郡守或诸郡的总管，负责清剿盗匪，屈突通、鱼惧罗、张须陀、陈稜等都被安排了新的平乱任务。
此刻，虞世基站出来道：“陛下，眼下正是用人之际，宇文述、王仁恭、卫玄等将军，虽然在辽东轻敌兵败，但是天下哪有一次不败的常胜将军，所以，臣斗胆求情，重新宽恕这几位将军的罪责，恢复启用，派往地方，戴罪立功，若是再有失利，从重处理也不迟。”
鱼成都站出来道：“臣附议，岳丈宇文述兢兢业业，对皇帝一片忠心，请陛下宽恕罪责，给诸位将军一次戴罪立功的机会。”
杨广皱起眉头，沉默不语，似乎也在考虑。
封德彝、独孤盛、元文都等越来越多的大臣站出求情，加上罗昭云不在这里，无人明着阻挡反驳，使得杨广终于松口了。
“那就赦免了宇文述、卫玄、王仁恭等，暂时不封爵位，只赐一官职，戴罪立功。”
“谢陛下恩准！”鱼成都大喜过望，终于解救了他的岳父。
“陛下英明！”虞世基等人起身，达到了目的。
裴蕴蹙眉，并不想宇文述这么快就官复原职，因为现在杨阀被铲除了，前四阀还有宇文阀、李阀、裴阀，若是宇文述被打压下去，宇文阀缺少了主心骨，他裴蕴带领的裴阀就能靠到前面去，争取到更多的利益。
虞世基、封德彝等人却跟宇文述关系很近，借助宇文阀的力量，可以办很多事，属于一个阵营，所以趁机施救。
其余大臣们不想掺和进来，所以都保持沉默了。